Enhance project structure with additional configuration files and directory organization

requirements.txt

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+# Webアプリ/UI + MCP対応
+gradio[mcp]>=5.3.0
+
+# データ処理
+pandas>=2.2.0
+numpy>=1.26.0
+openpyxl>=3.1.2
+
+# 機械学習（回帰や予兆解析で利用）
+scikit-learn>=1.5.0
+
+# 可視化（将来グラフ表示を追加する可能性を考慮）
+matplotlib>=3.8.0
+
+# Supabase連携
+supabase>=2.4.0
+python-dotenv>=1.0.0