Spaces:
Sleeping
Sleeping
Remove unused imports and dependencies
Browse files- requirements.txt +0 -2
- tumor_detection_app.py +37 -34
requirements.txt
CHANGED
|
@@ -2,8 +2,6 @@ streamlit
|
|
| 2 |
Pillow
|
| 3 |
numpy
|
| 4 |
pandas
|
| 5 |
-
h5py
|
| 6 |
-
matplotlib
|
| 7 |
opencv-python
|
| 8 |
scikit-learn
|
| 9 |
tensorflow
|
|
|
|
| 2 |
Pillow
|
| 3 |
numpy
|
| 4 |
pandas
|
|
|
|
|
|
|
| 5 |
opencv-python
|
| 6 |
scikit-learn
|
| 7 |
tensorflow
|
tumor_detection_app.py
CHANGED
|
@@ -2,10 +2,7 @@ import streamlit as st
|
|
| 2 |
from PIL import Image
|
| 3 |
import numpy as np
|
| 4 |
import pandas as pd
|
| 5 |
-
import base64
|
| 6 |
import os
|
| 7 |
-
import h5py
|
| 8 |
-
import matplotlib.pyplot as plt
|
| 9 |
|
| 10 |
# Streamlit ile HTML ve CSS ekleme
|
| 11 |
st.markdown(f"""
|
|
@@ -20,9 +17,6 @@ st.markdown(f"""
|
|
| 20 |
background-color: rgba(255, 255, 255, 0.8); /* Beyaz renk, %80 şeffaflık */
|
| 21 |
padding: 20px;
|
| 22 |
border-radius: 10px;
|
| 23 |
-
background-image: url("/Users/eceguney/Desktop/background.PNG"); /* Arka plan resminin yolu */
|
| 24 |
-
background-position: center;
|
| 25 |
-
background-repeat: no-repeat;
|
| 26 |
background-size: cover;
|
| 27 |
height: 100vh; /* Sayfa yüksekliği */
|
| 28 |
}}
|
|
@@ -46,14 +40,6 @@ st.markdown(f"""
|
|
| 46 |
.sidebar .sidebar-content {{
|
| 47 |
background-color: #f4f4f9;
|
| 48 |
}}
|
| 49 |
-
.section-title {{
|
| 50 |
-
color: #4CAF50;
|
| 51 |
-
font-size: 30px;
|
| 52 |
-
text-align: center;
|
| 53 |
-
margin: 20px 0;
|
| 54 |
-
border-bottom: 2px solid #4CAF50;
|
| 55 |
-
padding-bottom: 5px;
|
| 56 |
-
}}
|
| 57 |
|
| 58 |
.content-box {{
|
| 59 |
border: 2px solid #4CAF50;
|
|
@@ -88,10 +74,41 @@ st.markdown(f"""
|
|
| 88 |
# Ana başlık
|
| 89 |
st.title("Tümör Tespit Sistemi")
|
| 90 |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
| 91 |
# Menü çubuğu oluştur, her seçenek için benzersiz key parametresi ekle
|
| 92 |
# Sidebar menu
|
| 93 |
menu = st.sidebar.selectbox("Menü", ["Anasayfa", "Hakkımızda", "Tümör Tespiti","Örnek Analizlerimiz", "Hasta Yorumları", "Bize Ulaşın"], key="menu_selectbox")
|
| 94 |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
| 95 |
# Menüye göre sayfaların içeriğini değiştir
|
| 96 |
if menu == "Anasayfa":
|
| 97 |
st.markdown('<div class="header"><h2>Hoş Geldiniz!</h2></div>', unsafe_allow_html=True)
|
|
@@ -150,18 +167,14 @@ elif menu == "Örnek Analizlerimiz":
|
|
| 150 |
image = Image.open(file_path)
|
| 151 |
st.image(image, caption=f"MR Görüntüsü: {img_file}", use_container_width=True)
|
| 152 |
|
| 153 |
-
#
|
| 154 |
image_array = np.array(image)
|
| 155 |
-
|
| 156 |
|
| 157 |
-
#
|
| 158 |
-
if
|
| 159 |
-
tumor_status = "Tümör Tespit Edildi"
|
| 160 |
-
explanation = "Görüntüde yüksek kontrastlı alanlar tespit edildi, bu da tümör olasılığını artırıyor."
|
| 161 |
tumor_found_count += 1
|
| 162 |
else:
|
| 163 |
-
tumor_status = "Tümör Yok"
|
| 164 |
-
explanation = "Görüntüde belirgin bir kontrast farkı bulunmamaktadır, bu da tümör olmadığına işaret edebilir."
|
| 165 |
non_tumor_count += 1
|
| 166 |
|
| 167 |
# Sonuçları göster
|
|
@@ -200,19 +213,9 @@ elif menu == "Tümör Tespiti":
|
|
| 200 |
image = Image.open(uploaded_file)
|
| 201 |
st.image(image, caption="Yüklenen MR Görüntüsü", use_container_width=True)
|
| 202 |
|
| 203 |
-
# Görüntü
|
| 204 |
image_array = np.array(image)
|
| 205 |
-
|
| 206 |
-
# Örnek basit analiz: Görüntünün ortalama parlaklık değerini alalım
|
| 207 |
-
average_brightness = np.mean(image_array)
|
| 208 |
-
|
| 209 |
-
# Tümör var mı yok mu tahmini (basit bir yaklaşım)
|
| 210 |
-
if average_brightness < 100: # Bu eşik değeri tamamen örnektir, daha gelişmiş bir analiz için değiştirilmelidir.
|
| 211 |
-
tumor_status = "Tümör Tespit Edildi"
|
| 212 |
-
explanation = "Görüntüde yüksek kontrastlı alanlar tespit edildi, bu da tümör olasılığını artırıyor."
|
| 213 |
-
else:
|
| 214 |
-
tumor_status = "Tümör Yok"
|
| 215 |
-
explanation = "Görüntüde belirgin bir kontrast farkı bulunmamaktadır, bu da tümör olmadığına işaret edebilir."
|
| 216 |
|
| 217 |
# Sonuçları göster
|
| 218 |
st.markdown(f"**Sonuç: {tumor_status}**")
|
|
|
|
| 2 |
from PIL import Image
|
| 3 |
import numpy as np
|
| 4 |
import pandas as pd
|
|
|
|
| 5 |
import os
|
|
|
|
|
|
|
| 6 |
|
| 7 |
# Streamlit ile HTML ve CSS ekleme
|
| 8 |
st.markdown(f"""
|
|
|
|
| 17 |
background-color: rgba(255, 255, 255, 0.8); /* Beyaz renk, %80 şeffaflık */
|
| 18 |
padding: 20px;
|
| 19 |
border-radius: 10px;
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
| 20 |
background-size: cover;
|
| 21 |
height: 100vh; /* Sayfa yüksekliği */
|
| 22 |
}}
|
|
|
|
| 40 |
.sidebar .sidebar-content {{
|
| 41 |
background-color: #f4f4f9;
|
| 42 |
}}
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
| 43 |
|
| 44 |
.content-box {{
|
| 45 |
border: 2px solid #4CAF50;
|
|
|
|
| 74 |
# Ana başlık
|
| 75 |
st.title("Tümör Tespit Sistemi")
|
| 76 |
|
| 77 |
+
# Tümör tespiti için eşik değeri
|
| 78 |
+
TUMOR_BRIGHTNESS_THRESHOLD = 100
|
| 79 |
+
|
| 80 |
# Menü çubuğu oluştur, her seçenek için benzersiz key parametresi ekle
|
| 81 |
# Sidebar menu
|
| 82 |
menu = st.sidebar.selectbox("Menü", ["Anasayfa", "Hakkımızda", "Tümör Tespiti","Örnek Analizlerimiz", "Hasta Yorumları", "Bize Ulaşın"], key="menu_selectbox")
|
| 83 |
|
| 84 |
+
# Tümör tespiti fonksiyonu
|
| 85 |
+
def detect_tumor(image_array):
|
| 86 |
+
"""
|
| 87 |
+
Görüntü dizisini analiz ederek tümör tespiti yapar
|
| 88 |
+
|
| 89 |
+
Args:
|
| 90 |
+
image_array: Numpy array olarak görüntü
|
| 91 |
+
|
| 92 |
+
Returns:
|
| 93 |
+
tumor_status: Tümör durumu (string)
|
| 94 |
+
explanation: Açıklama metni (string)
|
| 95 |
+
has_tumor: Tümör var mı? (boolean)
|
| 96 |
+
"""
|
| 97 |
+
# Görüntünün ortalama parlaklık değerini hesapla
|
| 98 |
+
average_brightness = np.mean(image_array)
|
| 99 |
+
|
| 100 |
+
# Tümör var mı yok mu tahmini (basit bir yaklaşım)
|
| 101 |
+
if average_brightness < TUMOR_BRIGHTNESS_THRESHOLD: # Düşük parlaklık tümör olasılığını artırır
|
| 102 |
+
tumor_status = "Tümör Tespit Edildi"
|
| 103 |
+
explanation = "Görüntüde yüksek kontrastlı alanlar tespit edildi, bu da tümör olasılığını artırıyor."
|
| 104 |
+
has_tumor = True
|
| 105 |
+
else:
|
| 106 |
+
tumor_status = "Tümör Yok"
|
| 107 |
+
explanation = "Görüntüde belirgin bir kontrast farkı bulunmamaktadır, bu da tümör olmadığına işaret edebilir."
|
| 108 |
+
has_tumor = False
|
| 109 |
+
|
| 110 |
+
return tumor_status, explanation, has_tumor
|
| 111 |
+
|
| 112 |
# Menüye göre sayfaların içeriğini değiştir
|
| 113 |
if menu == "Anasayfa":
|
| 114 |
st.markdown('<div class="header"><h2>Hoş Geldiniz!</h2></div>', unsafe_allow_html=True)
|
|
|
|
| 167 |
image = Image.open(file_path)
|
| 168 |
st.image(image, caption=f"MR Görüntüsü: {img_file}", use_container_width=True)
|
| 169 |
|
| 170 |
+
# Görüntü analizi
|
| 171 |
image_array = np.array(image)
|
| 172 |
+
tumor_status, explanation, has_tumor = detect_tumor(image_array)
|
| 173 |
|
| 174 |
+
# Sayaçları güncelle
|
| 175 |
+
if has_tumor:
|
|
|
|
|
|
|
| 176 |
tumor_found_count += 1
|
| 177 |
else:
|
|
|
|
|
|
|
| 178 |
non_tumor_count += 1
|
| 179 |
|
| 180 |
# Sonuçları göster
|
|
|
|
| 213 |
image = Image.open(uploaded_file)
|
| 214 |
st.image(image, caption="Yüklenen MR Görüntüsü", use_container_width=True)
|
| 215 |
|
| 216 |
+
# Görüntü analizi
|
| 217 |
image_array = np.array(image)
|
| 218 |
+
tumor_status, explanation, _ = detect_tumor(image_array)
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
| 219 |
|
| 220 |
# Sonuçları göster
|
| 221 |
st.markdown(f"**Sonuç: {tumor_status}**")
|